1、在取卵后约1周左右，有个别患者会出现以下症状：在临床上会表现为腹胀，腹水（甚至胸水），卵巢增大，胃肠道不适，少尿等症状，称为卵巢过度刺激综合症（OHSS的）。该现象多见于多囊卵巢患者以及一些对药物敏感的人。轻度的卵巢过度刺激综合征不需特殊处理，重度的OHSS的则需留院观察及处理。卵巢过度刺激综合征的病人可以正常饮食，腹胀的患者以少食多餐为好。以低糖易消化易吸收食物为主。避免过度疲累，过强运动。不要腹部受压及撞伤。绝大多数病人经过积极的心理调整和一般的临床处理均可以安全度过。
2、有些人用促排卵药后反应欠佳，只有1-2个卵泡发育，这种情况多见于卵巢部分切除后，卵巢功能减退，卵巢不敏感综合征或是由于喷鼻药物用法不对所致。医生会根据情况与病人讨论是否放弃本周期。
3、极少数人的卵子会出现不受精或受精卵不能继续发育分裂等。这可能是由于卵子的品质问题或精子畸形率高等因素造成的，这种情况就要放弃移植。
4、手术过程有时会有出血，取卵后应遵医嘱静卧，口服抗生素预防感染。
5、个别人在早期妊娠会有少量出血现象，这是胚胎生根侵蚀到血管所引起的，属正常现象，不是流产，只要注意休息几天就会好转。个别人早期妊娠后照乙超发现是空囊，无胚芽，见不到胎心，胚胎停止发育等，这时应做清宫处理。
6、多胎妊娠需要减胎术：在超排卵行宫腔内人工授精或试管婴儿过程中，容易发生多胎，多胎发生率约为15-20％，多胎妊娠易发生流产，早产，妊高症，胎膜早破（。未足月破水），产后长期出血（子宫过度扩张）等妊娠并发症。早产儿生命力弱，难以存活，如新生儿颅内出血，脑瘫，新生儿呼吸窘迫综合征等。故妊娠3胎以上较好在6-8周接受减胎手术。 双胎妊娠在怀孕后期要小心护理，很容易出现早产或流产，要密切与医生联系。
7、宫外孕：发生率约3％，确切的原因仍未十分清楚，高危因素为盆腔粘连，当然并非所有盆腔粘连的病人一定会发生宫外孕经去除宫外孕病灶及安胎治疗，大部分宫内。妊娠可以继续下去。
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